Aptera est fouillée systématiquement ces dernières années par la 25ème Ephorie des Antiquités Préhistoriques et Classiques.

Le nom de la cité est déjà mentionné sur des tablettes en linéaire B (14-13ème siècles) et continue d’être utilisé jusqu’au 7ème siècle de notre ère, époque où la ville fut détruite par un séisme et les incursions des Sarasins.

Plus tard, pendant la deuxième période byzantine (961-1204), l’étendue de la ville est offerte au Monastère de Saint Jean de Patmos.

Au centre de la cité seront construites les installations moniales qui seront actives jusqu’en 1960.

Pendant le Soulèvement crétois de 1866-69, les Turcs y construiront une forteresse..

L’antique Aptera, fondée sur la colline Palekastro (200 m altitude), fut entourée d’un mur de fortification de 3480 m qui encerclait tout le sommet de la colline.

Deux ensembles de thermes conservés en élévation ont été fouillés et partiellement restaurés ainsi que les citernes qui leur était reliées, l’une d’entre elles (de l’époque romaine) est conservée intacte!
Un petit temple bipartite, dédié à Artémis et Apollon a egalement été fouillé.

Ces dernières années, l’ancien théâtre fait l’objet de fouille et de restauration. Il offre une vue panoramique sur les Montagnes Blanches.

Au Nord-est du site se dresse la forteresse turque d’où la vue sur la baie de Souda et les Montagnes Blanches est époustouflante.